Bio-OS任务挑战赛道赛题和规则

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一、赛道简介 Bio-OS目前已经开源到Github上(https://github.com/Bio-OS),本赛道主要围绕Bio-OS的平台能力提升和工具插件支持提供赛题。赛题分为开发类和工具类:

  • 开发类赛题主要面向具备IT背景的参赛团队,需要熟悉Go或者JS开发,基于Bio-OS的开源项目进行进行方案设计并最终实现和提交到Bio-OS仓库中。
  • 工具类赛题主要面向生物信息领域背景,熟悉生信常用软件和工具,擅长Python和R语言,在Bio-OS中提供生信的工具或者为Bio-OS Notebook插件提供可视化工具。

二、报名及参赛方式 报名链接:https://bytedance.feishu.cn/share/base/form/shrcnKJ45uwrNvBdrI0Fu2BW5mh?ccm_open_type=form_v2_link_share 报名要求:

  1. 大赛以组队的形式报名,每队1-5人
  2. 一支团队仅可报名一个赛道,若报名多个赛道,以最后一次报名为准
  3. 加入大赛交流群,寻找参赛队友和赛前辅导培训

三、赛题列表

赛题类型赛题描述难度系数赛题解读
工具类赛题基于开源Notebook插件集成可视化工具1https://github.com/Bio-OS/bioos/issues/19
开发类赛题实现工作流运行的任务监控2https://github.com/Bio-OS/bioos/issues/20
开发类赛题在命令行交互工具实现Notebook查询和启动2https://github.com/Bio-OS/bioos/issues/21
开发类赛题流程规范扩展:Nextflow、CWL、Snakemake等5https://github.com/Bio-OS/bioos/issues/22

四、评审标准 任务挑战赛道的赛题评审主要关注以下几个方面:

  • 所解决任务的难度系数
  • 任务的完成度,是否已解决赛题问题,是否提交代码和demo等
  • 解决方案的技术创新、算法改进、效率提升、用户体验等方面
  • 代码质量、文档质量、架构设计、demo演示等

五、本赛道奖金池 任务挑战赛

一等奖:5万 二等奖:3万 三等奖:1万 优胜奖(10个):1000元

六、Bio-OS文档及参考案例 Bio-OS文档汇总:https://www.volcengine.com/docs/6971/152949

七、提交材料(时间截止到11.28号24:00):

1.  提交材料收件邮箱

1.  账号:<bioosopensource@163.com>

1.  提交选定赛题(开发类T2,T3,T3)的方案设计文档,如果是工具类赛题(T1:Notebook插件可视化工具集成),则文档内容包含工具的介绍以及参数配置的介绍。

1.  文档中需包含Demo视频链接(可以将视频上传到比如B站或其他视频网站上并附上链接),包括使用的说明、代码、数据和生成的结果。

1.  提交源代码,可通过两种方式提交,一是将开源代码完整打包后通过邮箱和上述文档一起发送,二是通过github账号直接为下面的仓库提交PR,开发类提交到Bio-OS开源项目仓库中,工具类提交到Bio-mate开源项目仓库:

    -   Bio-OS开源项目仓库:https://github.com/Bio-OS/bioos
    -   Notebook插件Bio-Mate开源项目仓库:https://github.com/Bio-OS/bio-mate
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