一、赛道简介 Bio-OS目前已经开源到Github上(https://github.com/Bio-OS),本赛道主要围绕Bio-OS的平台能力提升和工具插件支持提供赛题。赛题分为开发类和工具类:
- 开发类赛题主要面向具备IT背景的参赛团队,需要熟悉Go或者JS开发,基于Bio-OS的开源项目进行进行方案设计并最终实现和提交到Bio-OS仓库中。
- 工具类赛题主要面向生物信息领域背景,熟悉生信常用软件和工具,擅长Python和R语言,在Bio-OS中提供生信的工具或者为Bio-OS Notebook插件提供可视化工具。
二、报名及参赛方式 报名链接:https://bytedance.feishu.cn/share/base/form/shrcnKJ45uwrNvBdrI0Fu2BW5mh?ccm_open_type=form_v2_link_share 报名要求:
- 大赛以组队的形式报名,每队1-5人
- 一支团队仅可报名一个赛道,若报名多个赛道,以最后一次报名为准
- 加入大赛交流群,寻找参赛队友和赛前辅导培训
三、赛题列表
赛题类型 | 赛题描述 | 难度系数 | 赛题解读 |
---|---|---|---|
工具类赛题 | 基于开源Notebook插件集成可视化工具 | 1 | https://github.com/Bio-OS/bioos/issues/19 |
开发类赛题 | 实现工作流运行的任务监控 | 2 | https://github.com/Bio-OS/bioos/issues/20 |
开发类赛题 | 在命令行交互工具实现Notebook查询和启动 | 2 | https://github.com/Bio-OS/bioos/issues/21 |
开发类赛题 | 流程规范扩展:Nextflow、CWL、Snakemake等 | 5 | https://github.com/Bio-OS/bioos/issues/22 |
四、评审标准 任务挑战赛道的赛题评审主要关注以下几个方面:
- 所解决任务的难度系数
- 任务的完成度,是否已解决赛题问题,是否提交代码和demo等
- 解决方案的技术创新、算法改进、效率提升、用户体验等方面
- 代码质量、文档质量、架构设计、demo演示等
五、本赛道奖金池 任务挑战赛
一等奖:5万 二等奖:3万 三等奖:1万 优胜奖(10个):1000元
六、Bio-OS文档及参考案例 Bio-OS文档汇总:https://www.volcengine.com/docs/6971/152949
七、提交材料(时间截止到11.28号24:00):
1. 提交材料收件邮箱
1. 账号:<bioosopensource@163.com>
1. 提交选定赛题(开发类T2,T3,T3)的方案设计文档,如果是工具类赛题(T1:Notebook插件可视化工具集成),则文档内容包含工具的介绍以及参数配置的介绍。
1. 文档中需包含Demo视频链接(可以将视频上传到比如B站或其他视频网站上并附上链接),包括使用的说明、代码、数据和生成的结果。
1. 提交源代码,可通过两种方式提交,一是将开源代码完整打包后通过邮箱和上述文档一起发送,二是通过github账号直接为下面的仓库提交PR,开发类提交到Bio-OS开源项目仓库中,工具类提交到Bio-mate开源项目仓库:
- Bio-OS开源项目仓库:https://github.com/Bio-OS/bioos
- Notebook插件Bio-Mate开源项目仓库:https://github.com/Bio-OS/bio-mate