论文复现挑战赛赛题和规则

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一、赛道简介 论文复现挑战赛采用 “开放赛题” 的形式,复现论文由参赛团队自行选择,并通过报名链接提交给组委会审核,审核通过后即组委会认定该论文可以参赛,并通知参赛团队Bio-OS账号和资源,开始进行比赛。具体需要遵循以下原则和标准。 二、论文复现

  1. 筛选标准
  • 文献范围:参赛者可自由选择自己感兴趣的、影响因子大于 5的相关论文。
  • 文献领域:以生物信息学、计算生物学等包含二级分析或三级计算分析的文献为主。
  • 发表时间:要求论文发表时间为2010年1月1日至2023年10月23日之间。
  • 可重复性:选择的论文应具有明确的数据分析流程和可复现的实验结果。
  1. 复现工作
  • 参赛者需自行准备与论文相关的数据,代码和工具。
  • 参赛者需使用 Bio-OS Workspace 复现选定论文的主要结果,包括但不限于数据处理、分析、结果验证等关键步骤,以及必要的图表、表格和其他可视化展示。
  • 记录复现报告,详细描述复现过程、遇到的问题、解决方案及最终复现结果。
  1. 提交材料
  • 提交选定论文的信息(标题、作者、发表期刊及日期)。
  • 提交Bio-OS Workspace项目链接,包括使用的说明、代码、数据和生成的结果。
  • 提交一份详细的复现报告,报告应包括但不限于:
    • 所选论文的简要介绍
    • 复现的主要步骤和方法
    • 复现的结果及其与原论文结果的比较
    • 遇到的困难和解决方案
    • Bio-OS Workspace在复现过程中的应用体验

三、报名及参赛方式 报名链接: https://bytedance.feishu.cn/share/base/form/shrcnKJ45uwrNvBdrI0Fu2BW5mh

报名要求:

  1. 大赛以组队的形式报名,每队1-5人
  2. 一支团队仅可报名一个赛道,若报名多个赛道,以最后一次报名为准
  3. 加入大赛交流群,寻找参赛队友和赛前辅导培训

四、评审标准 论文复现挑战赛由行业资深评委评分,主要参考以下几个维度:

  • 论文影响力:根据选定论文的发表时间和影响因子评估。
  • 复现难易度:根据复现论文是否有提供源代码或者公开的指导资料评估。
  • 复现完整度:根据复现结果的准确性、完整性和解决遇到问题的能力评估。
  • Bio-OS Workspace的应用: 评估参赛者利用 Bio-OS Workspace 的能力,包括数据处理、分析流程设计、图表制作等。

五、本赛道奖金池

  • 一等奖:5万
  • 二等奖:3万
  • 三等奖:1万
  • 优胜奖(10个):1000元

六、Bio-OS文档及参考案例 Bio-OS文档汇总:Bio-OS介绍:https://www.volcengine.com/docs/6971/152949

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