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本节介绍:基于
‘UpSet图’
分析不同数据预处理下对模型性能的影响
,数据采用模拟数据无任何现实意义,作者根据个人对机器学习的理解进行代码实现与图表输出,细节并不保证与参考一定相同,仅供参考。
详细数据和代码将在稍后上传至交流群,付费群成员可在交流群中获取下载。需要的朋友可关注公众文末提供的购买方式。
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✨ 参考可视化✨
✨ 仿图 ✨
✨ 参考可视化解读 ✨
可视化展示不同数据预处理方法(如SG、D1、D2、SNV、MSC)在不同机器学习模型(如AdaBoost、XGBoost、RF、GBDT)下对召回率(Recall)性能的影响。每个模型的性能图表使用条形图表示,条形图的高度表示召回率,图表下方则显示了不同数据预处理方法的组合(通过UpSet图的形式表示),展示了每种数据预处理方式的不同组合对模型的效果,其实这个可视化图并不是严格的UpSet图。完整的UpSet图还包含每个集合中元素的总数量,即这里所展示的对于每种情况评价指标汇总的柱状图
✨ 代码实现 ✨
index = pd.MultiIndex.from_tuples(
[(True, False, False, False, False,), (False, True, False, False, False,),
(False, False, True, False, False,), (False, False, False, True, False,),
(False, False, False, True, True,), (False, True, False, False, True,),
(True, False, False, False, True,)],
names=['Original', 'Mean Imputation', 'Most Frequent Imputation', 'Drop Missing', 'RFE']
)
创建一个多重索引(
MultiIndex
),由5个布尔值的元组组成,每个元组表示不同的预处理组合,并且为每个布尔值设置了相应的标签('Original'、'Mean Imputation'、'Most Frequent Imputation'、'Drop Missing'、'RFE')。这些组合可以用来标识不同的数据预处理方法
其实这里就是模拟存在缺失值的数据,并对其进行了不同的缺失值填补方法(如均值填补、最频繁值填补)或直接删除缺失样本,随后进行了特征筛选,最终计算了相应的评价指标
data = pd.DataFrame({'value': np.array(results_df['ROC-AUC'])}, index=index)
series = data['value'].sort_values(ascending=False)
series
创建一个包含'ROC-AUC'值的DataFrame,并使用之前定义的
index
作为行索引,然后将该DataFrame按'ROC-AUC'值进行降序排序,并返回排序后的Series
from upsetplot import plot
# 设置绘图的样式
plt.figure(figsize=(15, 6),dpi=1200)
# 绘制UpSet图,使用排序后的数据
ax = plot(series, facecolor="black")
# 获取绘图返回的 Axes 对象
ax = plt.gca() # 获取当前的 Axes 对象
# 添加标题并进行格式化
plt.suptitle('XGBoost', fontsize=16, weight='bold', color='black', y=1.05)
# 修改坐标轴标签的字体大小
plt.xlabel('Sets', fontsize=12)
plt.ylabel('ROC-AUC', fontsize=12)
for bar in ax.patches:
height = bar.get_height()
ax.text(bar.get_x() + bar.get_width() / 2, height + 0.01, f'{height:.2f}',
ha='center', va='bottom', fontsize=10, color='black')
plt.grid(True, which='both', axis='y', linestyle='--', color='gray', alpha=0.5)
plt.tight_layout()
plt.savefig("1.pdf", format='pdf', bbox_inches='tight')
plt.show()
使用upsetplot库绘制了一个UpSet图,并对其进行了一系列自定义设置,包括调整图形尺寸、标题、坐标轴标签、显示ROC-AUC值、添加网格线
这张图是一个完整的UpSet图,左下角展示了不同数据预处理方法下评价指标的总和,每一行的黑色圆点表示该数据预处理组合所包含的预处理方法(例如“Most Frequent Imputation”、“Mean Imputation”等)。右上方的条形图展示了每个组合的ROC-AUC值,反映了不同数据预处理方法对模型性能的影响。所以参考图表可以视为一个不完整的UpSet图,缺少了左下角的柱状图。因此,可以将该柱状图删除,因为它在表示不同数据预处理对模型性能的影响时并没有实质性意义。
✨ 该文章案例 ✨
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