期刊配图:模型可解释性分析SHAP极坐标图与蜂巢图的组合展示

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本节介绍:基于参考可视化的shap组合形式 。数据采用模拟数据,作者根据个人对机器学习的理解进行代码实现与图表输出,细节并不保证与原文一定相同,仅供参考。 详细数据和代码将在稍后上传至交流群,付费成员可在交流群中获取下载。需要的朋友可关注公众文末提供的购买方式。 购买前请咨询,避免不必要的问题。 文末点赞、推荐、转发参与免费包邮赠书~

✨ 参考可视化 ✨

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✨ 模拟可视化 ✨

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✨ 代码实现 ✨

  
import pandas as pd  
import numpy as np  
import matplotlib.pyplot as plt  
plt.rcParams['font.family'] = 'Times New Roman'  
plt.rcParams['axes.unicode_minus'] = False  
import warnings  
# 忽略所有警告  
warnings.filterwarnings("ignore")  
  
path = r"2025-4-11公众号Python机器学习AI.xlsx"  
df = pd.read_excel(path)  
from sklearn.model_selection import train_test_split  
  
# 划分特征和目标变量  
X = df.drop(['Electrical_cardioversion'], axis=1)    
y = df['Electrical_cardioversion']    
# 划分训练集和测试集  
X_train, X_test, y_train, y_test = train_test_split(  
    X,    
    y,   
    test_size=0.3,   
    random_state=42,   
    stratify=df['Electrical_cardioversion']   
)  
from xgboost import XGBClassifier  
from sklearn.model_selection import GridSearchCV, KFold  
from sklearn.metrics import accuracy_score, roc_auc_score  
  
# 定义 XGBoost 分类模型  
model_xgb = XGBClassifier(use_label_encoder=False, eval_metric='logloss', random_state=8)  
  
# 定义参数网格  
param_grid = {  
    'n_estimators': [50, 100, 200],  
    'max_depth': [3, 5, 7],  
    'learning_rate': [0.01, 0.1, 0.2],  
    'subsample': [0.8, 1.0],  
    'colsample_bytree': [0.8, 1.0]  
}  
  
# 使用 K 折交叉验证  
kfold = KFold(n_splits=5, shuffle=True, random_state=8)  
  
# 使用网格搜索寻找最佳参数  
grid_search = GridSearchCV(estimator=model_xgb, param_grid=param_grid, scoring='accuracy',   
                           cv=kfold, verbose=1, n_jobs=-1)  
  
# 拟合模型  
grid_search.fit(X_train, y_train)  
# 使用最优参数训练模型  
xgboost = grid_search.best_estimator_  
import sys  
import os  
# 将标准输出重定向到os.devnull  
sys.stdout = open(os.devnull, 'w')  
import shap  
explainer = shap.TreeExplainer(xgboost)  
shap_values = explainer.shap_values(X_test)   
plt.figure()  
shap.summary_plot(shap_values, X_test, feature_names=X_test.columns, plot_type="dot", max_display=10, show=False, cmap="coolwarm")   
# 设置 max_display 参数 来显示多少个特征  
plt.savefig("1.pdf", format='pdf', bbox_inches='tight', dpi=1200)  
plt.show()

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使用 XGBoost 分类模型,通过网格搜索和交叉验证优化超参数,并使用 SHAP 值对测试集进行解释,最终绘制并保存特征重要性可视化图(通过 SHAP summary plot)

  
plt.figure(figsize=(10, 5), dpi=1200)  
shap.summary_plot(shap_values, X_test, plot_type="bar", show=False)  
plt.tight_layout()  
plt.savefig("2.pdf", format='pdf',bbox_inches='tight')  
plt.show()

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绘制 SHAP 值的条形图(bar 类型),把这两个可视化组合起来就得到了最基础的shap组合图

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左边的条形图显示了每个特征的平均 SHAP 值(特征对模型输出的平均影响),帮助识别哪些特征对模型的预测贡献最大;右边的散点图则展示了每个特征的 SHAP 值如何随特征值的变化而变化,并通过颜色表示特征值的高低,帮助理解特征值对模型输出的具体影响

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现在,通过将左侧的可视化替换为当前的极坐标图,能够展示每个特征对模型输出的影响大小,并以更直观的方式表现各特征的重要性,从而达到文献复现的效果,里面的ECV代表的是模型目标

✨ 该文章案例 ✨

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在上传至交流群的文件中,像往期文章一样,将对案例进行逐步分析,确保读者能够达到最佳的学习效果。内容都经过详细解读,帮助读者深入理解模型的实现过程和数据分析步骤,从而最大化学习成果。

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