大赛简介
首届 Bio-OS 开源开放大赛由国家生物数据中心体系粤港澳大湾区节点（筹）主办，Bio-OS社区承办，协办单位包括中国生物信息学学会、上海市生物信息学会、广东省生物信息学学会。大赛以“开源共赢，科学无限”为宗旨，面向生物信息学研究人员和高校学生、开发者以及数据科学家们的全国性大数据竞赛。参赛者们既可以利用 Bio-OS 平台进行生物信息学研究，也可以为平台拓展功能和应用。希望通过此次大赛不仅可以挖掘和培养领域人才，更能促进生物科学、数据科学和人工智能的交叉融合，为生物信息学的发展做出贡献。
赛制说明
本次大赛共分为三个赛道，分别是“论文复现赛”， “任务挑战赛” 和 “开源贡献打榜赛”，具体赛道参赛规则如下：
注：
- 大赛以组队的形式报名，每队1-5人
- 一支团队仅可报名一个赛道，若报名多个赛道，以最后一次报名为准
- 加入大赛交流群，寻找参赛队友和赛前辅导培训
| 赛道 | 主题内容 | 赛题及打分规则 |
|---|---|---|
| 论文复现赛 | 主办方提供平台和资源，参赛团队任选一篇优质论文，并在Bio-OS平台上复现论文并提交结果。 | 论文复现挑战赛赛题和规则 |
| 任务挑战赛 | 任务挑战赛是基于开源的Bio-OS项目，具有一定的挑战性。分为针对IT背景的开发类任务和面向生物信息领域的工具类任务。参赛团队需要选择并完成某一任务，并提交结果。 | Bio-OS任务挑战赛道赛题和规则 |
| 开源贡献打榜赛 | 开源贡献打榜赛适合希望参与和了解开源Bio-OS项目的参赛者，参与和贡献的难度较低。参赛者自由贡献不限于代码、文档、设计等内容，根据贡献度积分规则排行。 | 开源贡献打榜赛规则说明 |
参赛时间
| 事项 | 时间 |
|---|---|
| 组队报名 | 2023年10月24日 至 2023年11月15日 |
| 初赛阶段 | 2023年11月1日 至 2023年11月28日 |
| 初赛评审阶段 | 2023年11月29日 至 2023年11月30日 |
| 线下总决赛 | 2023年12月6日 |
| 大赛颁奖典礼 | 2023年12月7日 |
奖金设置
大赛共设置 2 2 万 奖金池，通过初赛的选手邀请参加在北京举办的线下总决赛，接受业内专家答辩评审，最终决选出一等奖、二等奖、三等奖及优胜奖，瓜分现金大奖。
| 赛道 | 奖金总额 | 奖金设置 |
|---|---|---|
| 论文复现挑战赛 | 10万 | 一等奖：5万、二等奖：3万、三等奖：1万、优胜奖（10个）：1000元 |
| 任务挑战赛 | 10万 | 一等奖：5万、二等奖：3万、三等奖：1万、优胜奖（10个）：1000元 |
| 开源贡献打榜赛 | 2万 | 一等奖：8000元、二等奖：3000元、三等奖：1000元、周榜前10名：200元*10 （共4周） |
重要说明：本次赛事涉及奖金为税前金额，获奖人需依法扣缴相应税款。主办方将会根据税务法律法规要求向税务机关提供必要的税务申报信息（包括身份信息、现金奖励金额等税务机关要求的信息），并由主办方依法完成相应税款的代扣代缴，代扣代缴税款由获奖者承担。
报名团队
| 公司/高校 | 团队名称 | 参与赛道 |
|---|---|---|
| 西湖大学 | 小朋友予先森 | 论文复现挑战赛 |
| 中山大学孙逸仙纪念医院 | 逸仙急诊 | 论文复现挑战赛 |
| 中国人民大学 | 我的心永远是冰冰哒 | 论文复现挑战赛 |
| 山东大学 | itol.toolkit | 论文复现挑战赛 |
| 中科院植物研究所 | 默默无闻的小熊 | 论文复现挑战赛 |
| 西湖大学 | 碱基对 | 论文复现挑战赛 |
| 复旦大学 | 老板说的都队 | 论文复现挑战赛 |
| 广州医科大学 | GZDLab | 论文复现挑战赛 |
| 南京农业大学 | 快快毕业 | 论文复现挑战赛 |
| 暂无 | 孤狼 | 论文复现挑战赛 |
| 西湖大学 | 就我一人 | 论文复现挑战赛 |
| 南京大学 | 尧了个尧 | 论文复现挑战赛 |
| 上海交通大学 | 复复小队 | 论文复现挑战赛 |
| 西安交通大学 | 创新研究阵线 | 论文复现挑战赛 |
| 华大基因 | 那里贵了 | 论文复现挑战赛 |
| 上海海洋大学 | 火箭三轮车 | 论文复现挑战赛 |
| 中国医科大学 | dnj | 论文复现挑战赛 |
| 华南农业大学 | Turf Elite | 论文复现挑战赛 |
| Mirimus. Inc | 蜜蜂 | 论文复现挑战赛 |
| 临港国家实验室 | 学习nature，发出nature，超越nature | 论文复现挑战赛 |
| 天津大学 | tubic | 论文复现挑战赛 |
| 中国农业科学院深圳基因组研究所 | 塔容万物 | 论文复现挑战赛 |
| 华中科技大学 | 水果派 | 论文复现挑战赛 |
| 成都东软学院 | GHL | 论文复现挑战赛 |
| 长春中医药大学 | Bio-长中医 | 论文复现挑战赛 |
| 香港大学 | 冲冲冲 | 论文复现挑战赛 |
| 中国农业科学院 | 呱呱呱呱 | 论文复现挑战赛 |
| 华南农业大学 | 辣椒 | 论文复现挑战赛 |
| 中山大学 | 我们是一队 | 论文复现挑战赛 |
| 湖南农业大学 | 菜椒小玄 | 论文复现挑战赛 |
| 上海中医药大学 | 金小贝 | 论文复现挑战赛 |
| 西安外事学院 | chord的小队 | 论文复现挑战赛 |
| 安徽大学 | 赢麻了 | 论文复现挑战赛 |
| 南昌大学 | WWW | 论文复现挑战赛 |
| 慕尼黑工业大学 | 4SCIence | 论文复现挑战赛 |
| 广州基迪奥生物科技有限公司 | 勇敢的小菜鸟 | 论文复现挑战赛 |
| 成都东软学院 | 我们是Bio-OS中奖队 | 论文复现挑战赛 |
| 西安电子科技大学 | 我来啦 | 论文复现挑战赛 |
| 成都东软学院 | 梅奥诊所 | 论文复现挑战赛 |
| 济南大学 | champion | 论文复现挑战赛 |
| 成都东软学院 | 踏寻 | 论文复现挑战赛 |
| 广东明志医学检验室 | hfk | 开源贡献打榜赛 |
| 广东医科大学 | WAAT | 论文复现挑战赛 |
| 中科生信生物技术有限公司 | 字节居士 | 论文复现挑战赛 |
| 中国科学院植物研究所 | 666 | 论文复现挑战赛 |
| 浙江大学 华南农业大学 福建农林大学 浙江农林大学 | 一超多强 | 论文复现挑战赛 |
| 哥本哈根大学 | 跨专业 | 论文复现挑战赛 |
| 中国科学院大学 | Pluto | 论文复现挑战赛 |
| 华中农业大学 | 有才华大头兵 | 论文复现挑战赛 |
| 四川谛听人工智能科技 | 云图 | 论文复现挑战赛 |
| 成都东软学院 | 长城守卫 | 论文复现挑战赛 |
| 齐碳 | SequenceSquad | 论文复现挑战赛 |
| 南开大学 | NKICS复现团队 | 论文复现挑战赛 |
| 上海交通大学 | Bioinfoexplorer | 论文复现挑战赛 |
| 昆明理工大学 | Bioinfo | 论文复现挑战赛 |
| 中国农业大学 | MIH | 论文复现挑战赛 |
| 华南农业大学 | 代码打得都队 | 论文复现挑战赛 |
| 电子科技大学 | 无组队 | 论文复现挑战赛 |
| 香港大学 | 团队名称 | 论文复现挑战赛 |
| 深圳大学 | 飞天神猪 | 论文复现挑战赛 |
| 联川生物 | 且行之队 | 论文复现挑战赛 |
| 南京医科大学 | 不醒人室 | 论文复现挑战赛 |
| UCAS | 小鹰呼叫老鹰 | 论文复现挑战赛 |
| 浙江大学 | QYD@HJH | 论文复现挑战赛 |
| 北京大学 | 碱基跳动 | 论文复现挑战赛 |
| 中国科学院大学 | 木同 | 论文复现挑战赛 |
| 浙江大学 | GeneHunter | 论文复现挑战赛 |
| 成都东软学院 | 天韵队 | 论文复现挑战赛 |
| 中国科学院广州生物医药与健康研究院 | 为辉哥卖命迷你分队 | 论文复现挑战赛 |
| 浙江大学 | Caolab Group | 论文复现挑战赛 |
| 广州实验室 | 酶底物预测 | 论文复现挑战赛 |
| 成都东软学院 | Bio_Tree | 论文复现挑战赛 |
| 广州实验室 | 啊对对队 | 论文复现挑战赛 |
| 中国科学院广州生物医药与健康研究院 | 细胞谱系航海家 | 论文复现挑战赛 |
| 电子科技大学 | 一拖四队 | 论文复现挑战赛 |
| 成都东软学院 | 干饭不想排队 | 论文复现挑战赛 |
| 广东药科大学 | vocal大队 | 论文复现挑战赛 |
| 哈尔滨工业大学 | 哈工大zty老师队 | 论文复现挑战赛 |
| 香港中文大学 | 碱基互补队 | 论文复现挑战赛 |
| 清华大学 | 卡皮巴拉吃西瓜 | 论文复现挑战赛 |
| 四川大学生命科学学院 | 0.4e0.6i | 论文复现挑战赛 |
| 中国科学院大学 | 好好学习队 | 论文复现挑战赛 |
| 广西大学 | misen | 论文复现挑战赛 |
| 广州医科大学-广州实验室 | 图谱探险队 | 论文复现挑战赛 |
| 北京大学 | bug切割者队 | 论文复现挑战赛 |
| 中国科学院大学 | 碱基互补队 | 论文复现挑战赛 |
| 南京农业大学 | 紫金山开光者 | 论文复现挑战赛 |
| 广州实验室 | YFL group | 论文复现挑战赛 |
| 四川大学 | 0.6e0.4i | 论文复现挑战赛 |
| 山东大学 | 希望能赢 | 论文复现挑战赛 |
| 香港大学 | 进击的生信调查兵团 | 论文复现挑战赛 |
| 成都东软学院 | 深藏blue | 论文复现挑战赛 |
| 齐鲁师范学院 | bio-x2021 | 论文复现挑战赛 |
| 哈尔滨工业大学（深圳） | 秃驴蹄子队 | 论文复现挑战赛 |
| 成都东软学院 | 五人团队 | 论文复现挑战赛 |
| 哈尔滨工业大学（深圳） | 遥遥领先 | 论文复现挑战赛 |
| 哈尔滨工业大学（深圳） | 今天也要good good study | 论文复现挑战赛 |
| 河南大学 | 药渊智探 | 论文复现挑战赛 |
| 石河子大学 | 石河子大学代表队 | 论文复现挑战赛 |
| 生物岛实验室 | Team Jin-Lab | 论文复现挑战赛 |
| 南方医院 | 凉炒冰战队 | 论文复现挑战赛 |
| 广州医科大学 | 一往无钱队 | 论文复现挑战赛 |
| 四川大学 | 锦鲤吃高粱 | 论文复现挑战赛 |
| 哈尔滨医科大学 | 可爱小胖春今天学习了么 | 论文复现挑战赛 |
| 广州中鑫基因医学科技有限公司 | 碱基互补队 | 论文复现挑战赛 |
| 成都东软学院 | 火眼金睛队 | 论文复现挑战赛 |
| 四川农业大学 | 海底小纵队 | 论文复现挑战赛 |
| 广州实验室 | 983小分队 | 论文复现挑战赛 |
| 广州实验室 | 拟南芥root_user | 论文复现挑战赛 |
| 暨南大学 | 三读五队 | 论文复现挑战赛 |
| 广州实验室 | 生信小白 | 论文复现挑战赛 |
| 中国科学院上海营养与健康研究所 | CSBio-2 | 论文复现挑战赛 |
| 复旦大学 | PZHZ | 论文复现挑战赛 |
| 中国科学院上海营养与健康研究所 | CSBio-1 | 论文复现挑战赛 |
| 成都东软学院 | 完美复现队 | 论文复现挑战赛 |
| 成都东软学院 | 快乐城堡 | 论文复现挑战赛 |
| 广西科技大学 | 金冠王中旺 | 论文复现挑战赛 |
| 广东省人民医院 | VRGFs | 论文复现挑战赛 |
| 成都东软学院 | 学论语 | 论文复现挑战赛 |
| 中国科学院大学 | 二五仔队 | 论文复现挑战赛 |
| 杭州研趣生物科技有限公司 | 研趣生物 | 论文复现挑战赛 |
| 广州医科大学 | 胡里湖涂队 | 论文复现挑战赛 |
| 电子科技大学 | 无组队 | 论文复现挑战赛 |
| 成都东软学院 | 岁寒三友 | 论文复现挑战赛 |
| 慧壹科技（上海）有限公司 | ss_workstation | 论文复现挑战赛 |
| 中山大学 | bio | 论文复现挑战赛 |
| 成都东软学院 | 生物医学工程组 | 论文复现挑战赛 |
| 个人 | 海底小队 | 论文复现挑战赛 |
| 个人 | 钮钴禄甄嬛屠龙队 | 论文复现挑战赛 |
| 个人 | 肯德基疯狂吃鸡 | 论文复现挑战赛 |
| 个人 | Bio-OS冲冲冲 | 论文复现挑战赛 |
| 个人 | 米奇妙妙屋 | 论文复现挑战赛 |
| 南京医科大学 | lijiebio | 任务挑战赛 |
| 百度 | GoGoGo | 任务挑战赛 |
| 南京大学 | 其实我也没上过学 | 任务挑战赛 |
| 上海交通大学 | 哦哈哟学妹 | 任务挑战赛 |
| 华中农业大学 | 螃蟹 | 任务挑战赛 |
| 中山大学 | 319 | 任务挑战赛 |
| 团队 | 两条鱼 | 任务挑战赛 |
| 华中农业大学 | 叫什么名字 | 任务挑战赛 |
| 中国医学科学院肿瘤医院 | 明远鸢 | 任务挑战赛 |
| 齐鲁工业大学（山东省科学院） | LuminoScribe | 任务挑战赛 |
| 上海海洋大学 | 原神怎么你了 | 任务挑战赛 |
| 自由身份 | Clippers | 任务挑战赛 |
| 奥胡斯大学 | error free | 任务挑战赛 |
| 华大研究院 | 目前在忙装修 | 任务挑战赛 |
| 中国农业大学 | 只发CNS | 任务挑战赛 |
| 中山大学 | 4Ueyez0nly | 任务挑战赛 |
| 中国农业科学院深圳农业基因组研究所 | AGIS算法天团 | 任务挑战赛 |
| 深圳字节跳动信息科技有限公司 | 百奥云YYDS | 任务挑战赛 |
| 上海交通大学医学院附属瑞金医院 | Hiplot | 任务挑战赛 |
| 山东农业大学 | APEX ONE | 任务挑战赛 |
| 厦门大学 | goodgood | 任务挑战赛 |
| 北京林业大学 | 236队 | 任务挑战赛 |
| 广西大学 | 打酱油的 | 任务挑战赛 |
| 南京医科大学 | 生信散修队 | 任务挑战赛 |
| 中国科学院大学 | 霁小幻团队 | 任务挑战赛 |
| 中国科学院大学 | 早睡早起队 | 任务挑战赛 |
| 湾联科技（广州）有限公司 | CHSNP Inc. | 任务挑战赛 |
| 南方医科大学 | SMUYuLab | 任务挑战赛 |
| 中国医科大学 | 中国第一困 | 任务挑战赛 |
| 中科院北京基因组研究所（国家生物信息中心） | 我不会WDL | 任务挑战赛 |
| 华南理工大学 | 葡萄啵啵 | 任务挑战赛 |
| 微远 | 生信it | 任务挑战赛 |
| 南京大学 | 队队队 | 任务挑战赛 |
| 广州金域医学检验中心有限公司 | 广州金域基因组生信小队 | 任务挑战赛 |
| 复旦大学 | 指鹿为马 | 任务挑战赛 |
| 中国科学院大学杭州高等研究院 | 好好玩 | 任务挑战赛 |
| 哈尔滨医科大学 | LQ | 开源贡献打榜赛 |
| 燕山大学 | fff | 开源贡献打榜赛 |
| 中国科学院大学 | 国科大的月梦 | 开源贡献打榜赛 |
| 看见概念(上海)智能科技有限公司 | 宫廷玉液酒 | 开源贡献打榜赛 |
| 河北金融学院 | 1Q24 | 开源贡献打榜赛 |
| 北京科技大学 | 看不懂代码 | 开源贡献打榜赛 |
| 武汉百易汇能 | justdoit | 开源贡献打榜赛 |
| 南京农业大学 | 学以致用 | 开源贡献打榜赛 |
| 中国药科大学 | xxx | 开源贡献打榜赛 |
| 浙江卫视 | rip4bram | 开源贡献打榜赛 |
| 哈尔滨医科大学 | 诺欧通神祇的子嗣 | 开源贡献打榜赛 |
| 重庆理工大学 | 时间原理 | 开源贡献打榜赛 |
| 澳门大学 | 黑海加尔 | 开源贡献打榜赛 |
| 广东药科大学 | 挣点窝囊费 | 开源贡献打榜赛 |
| 无 | 自由贡献 | 开源贡献打榜赛 |
| 中山大学 | BioZSYK | 开源贡献打榜赛 |
| 同济大学 | yucca | 开源贡献打榜赛 |
关于Bio-OS
Bio-OS生物医学大数据操作系统是一款全新的生物医学信息分析平台，由广州实验室和火山引擎联合推出。它基于云原生化架构，提供了广泛的核心能力，包括生物医学数据传输、数据存储、数据管理和生物信息分析等。Bio-OS平台贯穿了生物医学研究的整个生命周期，包括预处理、处理和后处理三个阶段。它以Workspace为核心，采用开放兼容的技术架构，旨在帮助生物信息从业人员实现分析流程的可重入性、研究结果的可复现性、操作过程的可追溯性，以及知识的沉淀和传播。同时Bio-OS平台支持全球基因组学与健康联盟GA4GH社区的开放标准和规范。它不断积累和沉淀公开标准的数据集和工具资源，使用户能够即取即用，快速进行任意数据规模的基因分析任务。
大赛主席：
| 名称 | title | 照片 |
|---|---|---|
| 李亦学 | 博士生导师, 广州国家实验室研究员，科学数据平台主任，上海科技大学特聘教授，上海交通大学生命科学与技术学院教授 |
评委专家
评委按照姓氏首字母排序
| 评委名字 | title | 照片 |
|---|---|---|
| 蔡宏民 | 华南理工大学计算机学科学与技术学院教授、博士生导师，CCF 杰出会员，中国计算机学会生物信息学专业委员会常务委员 | |
| 杨跃东 | 中山大学计算机学院教授，兼国家超算广州中心副总工程师，国家特聘青年人才，2021、2022年度全球前2%最有影响力科学家 | |
| 王秀杰 | 中国科学院遗传发育所研究员、分子系统生物学研究中心主任，中央国家机关五四奖章标兵，全国五一巾帼标兵 | |
| 叶凯 | 叶凯，教授，博导，获国家杰出青年科学基金，科技部重点研发专项等资助，信息与生物医学交叉研究中心负责人，西安交大第一附属医院单细胞测序平台主任 | |
| 赵兴明 | 国家杰出青年科学基金获得者，复旦大学特聘教授、中山医院双聘教授，计算神经科学与类脑智能教育部重点实验室副主任 | |
| 赵方庆 | 中国科学院北京生命科学研究院研究员，获得中科院“百人计划”、国家杰出青年科学基金、中国科学院特聘研究员等资助。现任中科院北京生科院科研部副主任，中国生物工程学会生物信息学与计算生物学专委会副主任 | |
| 张鑫 | 字节跳动开源委员会治理运营负责人、火山引擎副总裁 |
主办单位
国家生物数据中心体系粤港澳大湾区节点（筹）
承办单位
Bio-OS 社区
协办单位
中国生物信息学学会
上海生物信息学会
广东省生物信息学学会
赛事交流
联系邮箱：liuxiaomi.330@bytedance.com
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